• MakaleAçık Erişim2021Scopus SJRQ2
    The comparisons of fatty acid composition in some anaerobic gut fungi neocallimastix, orpinomyces, piromyces, and caecomyces

    Kar, Bülent; Özköse, Emin; Ekinci, Mehmet Sait

    The objective of this study were to identify the fatty acid composition for decanoic (C10:0), tridecanoic (C13:0), myristic (C14:0), pentadecanoic (C15:0), palmitic (C16:0), stearic (C18:0), oleic (C18:1n9c), linoleic (C18:2n6c), arachidic (C20:0), arachidonic (C20:4n6), heneicosanoic (C21:0), erucic (C22:1n9) and Cis-4,7,10,13,16,19-docosahexaenoic (C22:6n3) acids by Neocallimastix, Orpinomyces, Caecomyces and Piromyces species of rumen fungus during in vitro culture. Fatty acid (FA) profile of anaerobic fungi comprises carbon chains of length ranging from 10 to 22 were analyzed as methyl esters. Analysis of fatty acids was performed using Gas Chromatography-Mass Spectrophotometer (GC-MS). FA measures are presented as proportions of relative amounts (% total fatty acid). The highest amounts of fatty acids for all samples were found as myristic (C14:0) acid. The tridecanoic (C13:0) acid represented the second abundant FA in the fungi in all experimental groups. Stearic acid (C18:0) was the third major fatty acid for isolates investigated in the current study. In addition, another fatty acid was palmitic (C16:0) acid with relative amount representing >20% of total FA in all samples. Pentadecanoic (C15:0) acid could not be found in any other samples except Orpinomyces sp. (GMLF5). It is concluded that biohydrogenation of fatty acid composition by anaerobic gut fungi are very variable.

    AtıfScopus5WoS3OpenAlex5
    ScopusWeb of SciencePubMedİncele
  • MakaleYalnız künye2015
    Anaerobik Rumen Fungus İzolelerinin Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) Metodu ile Filogenetik Analizi

    Özköse, Emin; Ekinci, Mehmet Sait; Çömlekçioğlu, Uğur; Akyol, Ismail; Kar, Bülent

    Bu çalışmada farklı cinslere ait anerobik rumen fungus izolatları arasındaki ilişkinin ortaya konması amacıyla filogenetik analiz, yapılmıştır. Türkiye'nin farklı coğrafi bölgelerinden izole edilen onsekiz fungus kültürü Rastgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) tekniği ile analiz edilmiştir. İzole edilen onsekiz fungus kültürüne 10 baz uzunluğundaki primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) uygulanmıştır. Toplam olarak 64 markır bandı gözlemlenmiş ve bu bantların %92.18'inin polimorfik olduğu saptanmıştır. Çoğaltılan DNA büyüklükleri 100 bç ile 700 bç arasında değişmektedir. Fungusları birbirinden ayrıt etmek için önemli derecede polimorfizim gözlemlenmiş ve izole edilen 18 fungusun tamamı açık bir şekilde birbirinden ayrılmıştır

    AtıfTR Dizin2
    TR Dizinİncele