Yazarlar
Yayınlar
- Yüksek Lisans TeziAçık Erişim2023SARS-CoV-2 enfeksiyonunda SERINC3 ve SERINC5 gen bölgelerinin antiviral rolleri ve moleküler analizleri
Kevser Gecekuşu
SERINC genleri tüm ökaryotlarda bulunmakla birlikte bilinen moleküler fonksiyonları transmembran proteinlerini kodlamalarıdır. İnsan genomunda, transmembran topolojisine sahip homolog proteinleri kodlayan beş SERINC geni mevcuttur. SERINC3, poliomavirüs karşı etkinken, SERINC5'in antiretroviral aktivitesi göstermektedir. Yukarıda bahsedilen bilgiler ışığında dünya'da ve ülkemizde insan sağlığındaki yıkıcı etkilerinin belirlenmesi için covid-19 ile ilgili yapılacak bu tez çalışması ülkemizde SERINC bölgeleri ile yapılan ilk çalışma özelliğine sahiptir. Bu açıdan önemli bir yerde bulunmakla beraber gelecekteki yapılacak çalışmalara basamak niteliğindedir. SERINC3 ve SERINC5 genlerinin ekspresyon seviyelerinin belirlemek için, DNA ve cDNA sekans analizlerinden elde edilen veriler kullanılmıştır. Dizi çalışmaları sonunda, kullanılan hasta örneklerin de Serin3 için 671 mutasyonun 301 amaino asit değişikliğine neden olurken, Serin5 için 333 mutasyonun 105amaino asit değişikliğine neden olduğu belirlenmiştir. Gen ekspresyon çalışmaları sonunda elde edilen Ct değerleri Gene Globe program ile analiz edilmiştir. Çalışmada kullanılan genlerin verileri GAPDH geniyle normalize edilip 2-ΔΔCt formülünden çıkan verilerle istatistiksel analiz gerçekleştirilmiştir. Ekspresyon kat değişimi analizi için gruplar parametrik olmayan Mann-Whitney testi (p < 0.05) kullanılmıştır. Her iki gen içinde farklı genotipler ve hastalığın seyrini değiştirebilecek genetik özellikler belirlenmiştir.
- MakaleYayıncıda açık erişim2023Scopus SJRQ3Optimization Approach in Window Function Design for Real-Time Filter Applications
Serbet, Fatmanur; Kaya, Turgay
Eliminating the Gibbs oscillations that occur during the Finite Impulse Response (FIR) digital filter design with the Fourier Series method will ensure correct filtering. For this reason, the development of the window improves the performance of the filter and, therefore, the system. In this study, the cosh window function is designed using Particle Swarm Optimization, which is a preferred optimization method in many areas. Thus, alternatives to the standard results obtained from the existing traditional calculations will be produced, and different windows that perform the same function will be obtained. In addition, exponential and cosh window functions were designed in LabVIEW environment, which is a graphical programming language-based program, and the designed windows were analyzed at different parameter values. LabVIEW provides a fast and easy programming environment, and it provides the opportunity to realize real-Time applications with its external hardware. Utilizing this feature, the amplitude spectrum of cosh window designed in LabVIEW is displayed in real time for different window parameter values. As a result, FIR digital filters were designed using cosh window based on optimization and the cosh window designed in LabVIEW, and the distorted EEG signal was filtered using these filters and displayed in real time.
AtıfScopus8WoS5OpenAlex5İncele
