Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Yazarlar
Yayınlar
- Yüksek Lisans TeziAçık Erişim2022Tunceli'deki dağ keçilerinden izole edilen Neocallimastix sp.'lere ait Ksilanaz enziminin karakterizasyon
Berat Torcan
Doğadan, çeşitli endüstriler için suş mühendisliğini ve biyolojik işlemeyi yürütmeye devam eden çok sayıda mantar enzimi tanımlanmıştır. Bununla birlikte, bir dizi dal araştırılmış olsa da, mantar krallığının büyük çoğunluğu endüstriyel uygulamalar için keşfedilmemiş durumda. Neocallimastigomycota gibi anaerobik mantarlar, son zamanlarda mantar krallığı arasında biyokütleyi bozan enzimlerin en büyük çeşitliliğini barındırdığı tespit edilmiştir. Anaerobik funguslar (AF), doğada yenilenebilir enerji kaynağı olarak bulunan lignoselülozik biyokütlenin sindirilmesinde rol oynayan, genellikle herbivor hayvanların, son çalışmalarla deniz hayvanları ve sürüngenlerin de sindirim sisteminde bulundukları belirlenen, şimdiye kadar bilinen tek zorunlu AF grubunu oluşturan ender canlılardır. Biyoteknolojik uygulamalar açısından önemli olan rumen fungusları, Tunceli'de yayılış gösteren Anadolu Yaban Keçilerine (Bezoar-Capra aegagrus) ait dışkı örneklerinden izole edilmiş, morfolojik olarak cins düzeyinde Neocallimastix spp. olarak tanımlanmıştır. Bu izolatlardan yüksek enzim aktivitesine sahip olanlar seçilerek (DAF1, DAF2 ve DAF3) diğer analizlerde kullanılmıştır. Ksilanaz, likenaz ve karboksimetil selülaz enzimlerinin çalıştığı optimum pH, sıcaklık, inkübasyon süreleriyle enzimlerin termal stabilitesi belirlenmiştir. Enzim aktiviteleri yüksek oranda ekstraselüler olarak bulunmuştur. Enzim aktivitesi için optimum pH ve sıcaklık, ksilanı kullanılan izolatlarda sırasıyla 6 ve 50°C olarak belirlenmiştir. Samanlı besiyerinde geliştirilen izolatların (DAF1,DAF2 ve DAF3) ksilanazları için spesifik aktivite için sırasıyla 499±19,29, 560,42±9,39 ve 513,01±29,22 μmol/dk/ml olarak bulunmuştur. Ayrıca çalışmada kullanılan metal iyonlarının 1 mM konsantrasyonları enzim aktivitesi üzerinde olumlu etkisi olduğu gösterilmiştir.
- Yüksek Lisans TeziAçık Erişim2022Tunceli'de yayılış gösteren ruminant hayvanlardaki anaerobik fungusların moleküler tanımlanması
Murat Üstüntaş
Anaerobik Gut Funguslar (AGF) herbivor hayvanların sindirim kanalının bir parçası olan rumen içerisinde bulunan mikroorganizmalar arasında sahip olduğu fibrolitik enzim aktivitesi ve biyoteknolojik potansiyeli oldukça yüksek bazı enzimlerinden dolayı oldukça önemli bir gruptur. Aynı zamanda AGF'ların zorunlu anaerobik özelliği bu mikroorganizmaların kültüre alınma çalışmalarını da değerli olduğunu göstermiştir. Günümüzde AGF'ların cins düzeyinde yeni keşifleri devam ederken bu mikroorganizmaların bazı endsüstriyel alanlarda da çalışma sahaları genişlemektedir. Bu çalışmada Türkiye'de bulunan kültür koleksiyonuna ek olarak bugüne kadar çalışmamış bazı coğrafi bölgelerden olan Tunceli iline ait kırsal alanlardan elde edilen rumen dışkı örneklerinden AGF izolasyonu ve tanımlanması yapılmıştır. Bu tanımlama işlemi hem morfolojik hem de moleküler düzeyde gerçekleştirilmiştir. Moleküler düzeyde tanımlama yapılırken bu mikroorganizmaların internal transcribed spacer (ITS) bölgesi tercih edilmiştir. Elde edilen ITS agaroz jel görüntülemesinden sonra polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ürünlerinin dizi analizi yapılmıştır.Sekans analizi ve morfolojik gözlemler sonucu AGF'ların MUBAM_AGF 1,2,3,4,5,6,11 ve 12 stok numarası verilerekNeocallimastix sp.,MUBAM_AGF 7,8 ve 10 stok numaralı Orpinomyces sp. ve MUBAM_AGF 9 stok numarası verilerek kültüre alınmıştır. Sonuç olarak Tunceli bölgesinde ilk defa yapılan bu çalışma ile hem fungus kültür koleksiyonu hem de bu canlılarla ait DNA kütüphanesi oluşturulmuştur.
- MakaleYalnız künye2017Role of some selected fungi cultures on bioremediation of herbicide chlorsulfuron
Ergüven, Gökhan Önder
This study aims for the performance of certain soil fungi for bioremediation of chlorsulfuron herbicide solutions on chemical oxygen demand (COD), biochemical oxygen demand (BOD), total organic carbon (TOC) and active ingredient parameters under agitated culture conditions. Soil fungi were isolated from chlorsulfuron-free soil in an agricultural field. Based on the laboratory experiment results, A. Alternata had the highest removal rate for all parameters about 5-6 days. Additionally, it was observed that M. chlamydosporia showed the lowest COD and active ingredient removal efficiency. On the other hand, TOC removal rates were similar with P. simplicissimum, M. chlamydosporia and S. chartarum species nearly 53%. It was demonstrated that, there were a suitable isolated fungi species for bioremediation of chlorsulfuron in agricultural soil media. It was conducted that all isolated fungi demonstrated up to 50% ability to degrade chlorsulfuron on important environmental parameters.
AtıfScopus3
İncele - MakaleYalnız künye2016Scopus SJRQ3The capacity of some newly bacteria and fungi for biodegradation of herbicide trifluralin under agiated culture media
Erguven, G. O.; Bayhan, H.; Ikizoglu, B.; Kanat, G.; Nuhoglu, Y.
Bioremediation is the use of microorganisms to degrade environmental contaminants (pesticides, polyaromatic hydrocarbons etc.) into less toxic forms or compounds. In this study microbial biodegradation of trifluralin was performed in liquid media with 11 different types of identified fungi and bacteria cultures and their mixtures in agiated culture media. The isolated fungi and bacteria mixtures showed the highest degradation, reaching 93% in the chemical oxygen demand (COD) parameter in four days and 82% as trifluralin active ingredient in five days. Bacteria and fungi mixtures achieved 69% and 66% degradations of trifluralin active ingredient respectively. In the fungi studies, the best removal was achieved by M. Chlamydosporia at 80%, in the bacteria studies, the best removal was achieved by Bacillus simplex about 95% in five days. These different removal rates were due to the microbial differencies.
AtıfWoS16OpenAlex2
İncele