Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

• 2
• 1

Yazarlar

• Aldemir, Duygu(1)
• Can, Hüseyin(1)
• Döndüren, Ömer(1)
• Döşkaya, Mert(1)
• Gürüz, Adnan Yüksel(1)
• Ispir, Unal(1)
• Karahan, Murat(1)
• Karakavuk, Emrah(1)
• Karakavuk, Muhammet(1)
• Karakavuk, Tuğba(1)
• Kevser Gecekuşu(1)
• Muz, Mustafa Necati(1)
• Saglam, Naim(1)
• Sarieyyüpoglu, Mustafa(1)
• Seker, Engin(1)
• Çetinkaya, Burhan(1)
• Özdemir, Hüseyin Gökhan(1)

• Yüksek Lisans TeziAçık Erişim2023/r/munzur/6917
  SARS-CoV-2 enfeksiyonunda SERINC3 ve SERINC5 gen bölgelerinin antiviral rolleri ve moleküler analizleri

  Kevser Gecekuşu

  SERINC genleri tüm ökaryotlarda bulunmakla birlikte bilinen moleküler fonksiyonları transmembran proteinlerini kodlamalarıdır. İnsan genomunda, transmembran topolojisine sahip homolog proteinleri kodlayan beş SERINC geni mevcuttur. SERINC3, poliomavirüs karşı etkinken, SERINC5'in antiretroviral aktivitesi göstermektedir. Yukarıda bahsedilen bilgiler ışığında dünya'da ve ülkemizde insan sağlığındaki yıkıcı etkilerinin belirlenmesi için covid-19 ile ilgili yapılacak bu tez çalışması ülkemizde SERINC bölgeleri ile yapılan ilk çalışma özelliğine sahiptir. Bu açıdan önemli bir yerde bulunmakla beraber gelecekteki yapılacak çalışmalara basamak niteliğindedir. SERINC3 ve SERINC5 genlerinin ekspresyon seviyelerinin belirlemek için, DNA ve cDNA sekans analizlerinden elde edilen veriler kullanılmıştır. Dizi çalışmaları sonunda, kullanılan hasta örneklerin de Serin3 için 671 mutasyonun 301 amaino asit değişikliğine neden olurken, Serin5 için 333 mutasyonun 105amaino asit değişikliğine neden olduğu belirlenmiştir. Gen ekspresyon çalışmaları sonunda elde edilen Ct değerleri Gene Globe program ile analiz edilmiştir. Çalışmada kullanılan genlerin verileri GAPDH geniyle normalize edilip 2-ΔΔCt formülünden çıkan verilerle istatistiksel analiz gerçekleştirilmiştir. Ekspresyon kat değişimi analizi için gruplar parametrik olmayan Mann-Whitney testi (p < 0.05) kullanılmıştır. Her iki gen içinde farklı genotipler ve hastalığın seyrini değiştirebilecek genetik özellikler belirlenmiştir.

  İncele
• MakaleAçık Erişim2021Scopus SJRQ4/r/munzur/2964
  Presence of Neospora caninum DNA of Wild Birds from Turkey; [Türkiye’deki Vahşi Kuşlarda Neospora caninum DNA’sının Varlığı]

  Karakavuk, Muhammet; Can, Hüseyin; Aldemir, Duygu; Döndüren, Ömer; Karakavuk, Tuğba; Karakavuk, Emrah; Özdemir, Hüseyin Gökhan; Muz, Mustafa Necati; Gürüz, Adnan Yüksel; Döşkaya, Mert

  Objective: Neospora caninum is a protozoon parasite that has a worldwide distribution and mainly causes abortion in cattle and current serological evidence shows that the disease may be also zoonotic. Wild birds play a role as a reservoir of the disease in nature. The study aimed to determine the prensence of N. caninum in wild birds. Methods: In this study, the presence of neosporosis in wild birds (n=55) including 22 different species found in the western side of Turkey, was investigated by polymerase chain reaction (PCR). In addition, PCR positive samples were confirmed by sequencing, BLAST, and phylogenetic analysis using MEGA7. Results: Obtained results showed that the presence of N. caninum DNA was 5.45% (3/55) in brain-heart homogenates wild birds. The bird species which were found positive for N. caninum were little owl (Athene noctua), common buzzard (Buteo buteo), and little tern (Sternula albifrons). According to phylogenetic analysis and BLAST, all samples were compatible with reference N. caninum isolates. Conclusion: To the best of authors’ knowledge, this is the first study detecting N. caninum in little tern. In future studies, it may be interesting to investigate the prevalence of N. caninum in other wild animals to elucidate the transmission properties.

  • 
  AtıfScopus3·OpenAlex3

  İncele
• MakaleAçık Erişim2012Scopus SJRQ2/r/munzur/4197
  Investigation of Yersinia ruckeri Infection in Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) Farms by Polymerase Chain Reaction (PCR) and Bacteriological Culture

  Seker, Engin; Karahan, Murat; Ispir, Unal; Çetinkaya, Burhan; Saglam, Naim; Sarieyyüpoglu, Mustafa

  This study has been carried out to investigate the presence of Yersinia ruckeri, the causative agent of Enteric Red Mouth (ERM) disease, in rainbow trout fish breeding farms located in Elazig and Malatya provinces in Eastern Turkey. For this purpose, bacteriological culture and a specific polymerase chain reaction (PCR) have been compare with examine blood and intestine samples collected from adult and young rainbow trout fish as well as water samples collected from all the farms. Y. ruckeri was isolated and identified from eight of the 17 fish farms giving a proportion of 52.9% at fish farm. The disease was noted in five of the rainbow trout farms located in Elazig and three of the 11 rainbow trout farms located in Malatya. The agent was detected in five of the six young fish breeding farms. The isolation percentages of the causative agent at fish level were calculated as 25.7% (131/510) in adult and 31.7% (19/60) in young fish, giving an overall proportion of 26.3% (150/570). All the isolates have been successfully identified as Y ruckeri by species-specific PCR. No isolation could be made from water samples. It is therefore concluded that Y. ruckeri infection poses a significant threat to the fish farms in the study area and necessary precautions should urgently be taken in order to minimize economical losses due to ERM disease. A specific PCR can be utilized successfully in aquaculture for rapid identification of bacterial agents which will help to prevent spread of infectious diseases and will therefore contribute to the productivity of fishery sector.

  • 
  • 
  AtıfWoS6·OpenAlex7

  İncele