Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Yazarlar
- Karaman, Altuğ(5)
- Sönmez, Pınar Erecevıt(4)
- Yazdıç, Ferit Can(4)
- Gedik, Osman(3)
- Kar, Bülent(3)
- Tasar, Neslihan(3)
- Topal, E.Işıl Arslan(3)
- Topal, Murat(3)
- Öbek, Erdal(3)
- Cakilcioglu, Ugur(2)
- Dikici, Abdullah(2)
- Erguven, Gokhan Onder(2)
- Ertekin, Özlem(2)
- Kirbag, Sevda(2)
- Pıhtılı, Güzin(2)
- Süer, Ceren Sel(2)
- Toraman, Zülal Aşçı(2)
- Yücel, Halit(2)
- Akbulut, Ekrem(1)
- Akyüz, Mahıde Demıreloz(1)
- Araka, Özlem(1)
- Aydin, Sumeyye(1)
- Aydogdu, Burcu(1)
- Aytar, Mehmet(1)
- Baltacı, Nazlı(1)
- Baransel, Esra Sabancı(1)
- Bayhan, Hurrem(1)
- Can, Erkan(1)
- Coşansel, Çiğdem(1)
- Demirol, Ferhat(1)
- Ekinci, Kübra(1)
- Eryilmaz, Haydar(1)
- Gokhan, Haci Bayram(1)
- Gündüz, Fatih(1)
- Ikizoglu, Bahar(1)
- Ince, Muharrem(1)
- Ince, Olcay Kaplan(1)
- Ispır, Ünal(1)
- Kaya, Sema Kayapinar(1)
- Koluman, Ahmet(1)
Yayınlar
- MakaleAçık Erişim2021Antibacterial and Antifungal Features of Centaurea urvillei DC. subsp. urvillei that is herboized in Turkey
Cakilcioglu, Ugur; Sönmez, Pınar Erecevıt
Although there are many studies on the activities of different species, the compounds and effects of Centaurea L., the largest genus of the Turkish flora, on human health, no relevant studies have been conducted on the antimicrobial properties of the usable parts (above ground leaves, flowers) of C. urvillei DC. subsp urvillei against pathogenic microorganisms.This study aimed to show whether it prevents the growth of these microorganisms that cause infectious diseases in humans on bacteria, yeast, dermatophytes that cause infectious diseases in humans via well agar and microdilution method by applying a methanol solution of the usable parts of C. urvillei DC. subsp. urvillei. Regarding the antimicrobial susceptibility results, the plant solution formed a generally sensitive inhibition zone (14.66 mm-11.66 mm inhibition zone-1 diameter) on inhibition of growth of yeast, dermatophyte isolates and other bacteria. This means that 40 mg dose of C. urvillei DC. subsp. urvillei has antibacterial and antifungal that can prevent the growth of all test microorganisms (Escherichia coli ATCC 25922, Staphylococcus aureus ATCC 29213, Enterococcus faecalis ATCC 29212, Klepsiella pneumoniae clinical isolate, Candida albicans RSKK 02007, Candida glabrata RSKK 014019, Candida tropicalis RSKK 02011, Epidermophyton floccosum RSKK 14024, Trichophyton rubrum RSKK 03022) that cause disease. It is seen when we compared with the control group that there was no significant difference in bacteria, however, a significant difference was observed in yeast and dermatophytes (p
AtıfOpenAlex2TR Dizin1
İncele - MakaleAçık Erişim2020Investigation of Air Quality in Terms of Microbiological Density in Some Regions of the European Side of Istanbul Province
Erguven, Gokhan Onder; Aydin, Sumeyye; Bayhan, Hurrem; Ikizoglu, Bahar
Microbial fauna of the outdoor ambient air of Istanbul has been determined in European side of Istanbul province at four differentdistricts (Bakirkoy, Fatih, Basaksehir and Esenler) by active and passive sedimentation sampling methods. In addition tometeorological factors, the effect of urbanization and traffic density for the air microbial load is also determined. Outdoor airsampling was performed between April 2014 and November 2015. The sedimentation method was done by standart plate count agar(PCA) opening the cover of the petri dishes containing a prepared medium. Standart plate count agar (PCA) medium was used for thedetermination of total bacteria while malt extract agar (MEA) was used for fungi. The colonies formed at the end of this period werecounted and total number of bacteria and fungi per unit volume and area were determined. Air temperature, relative humidity, windspeed and direction were also recorded. As a result of the active sampling method, the most counted units of bacteria was determinedat 35°C in Basaksehir station as 222 CFU(Colony forming unit)/m³, maximum fungal was determined as 286 CFU/m³at 20°Cincubation temperature. The maximum amount of bacteria in the passive sampling method results at 35°C was in Bakirkoy station as9250 CFU/m³.
- MakaleAçık Erişim2020Screening of Antimicrobial Effect against Microorganisms Threatening to Human Health of the Endemic Plant; Centaurea saligna (C. Koch) Wagenitz from Turkey
Cakilcioglu, Ugur; Sönmez, Pınar Erecevıt
In this study, the antimicrobial effect researched on microorganisms threatening to human health of extract including methanol of Centaurea saligna that is endemic and used for therapy of many diseases. For disk diffusion method, this related extract is highly effective on the gram negative bacteria by its 20.3±0.5 mm inhibition area. Again to relation bacteria, gram positive bacteria are highly effective by 18.3±0.57 mm and 20.3±0.5 mm inhibition area. It has a effect against Candida species and Epidermophyton sp., the superficial skin infections are caused, by 9.6±0.5 mm and 13.6±1.5 mm inhibition area. On the other hand, for findings, this related extract is extremely effective against Trichophyton sp. that is one of dermatophyte fungi by 24.6±1.5 inhibition area. This natural extract shows its antimicrobial effect namely, by minimal inhibition value (MIC): 6.25 µL its lowest inhibition value against development of all the bacteria and dermatophyte fungi. This plant has a potential to be a natural antimicrobial agent to be used as a medicine for human health and life quality.
AtıfOpenAlex5TR Dizin2İncele - MakaleAçık Erişim2020SARS CoV-2 nsp1 Mutasyonlarının Protein Yapıda Ortaya Çıkardığı Değişimler
Akbulut, Ekrem; Kar, Bülent
Şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirüsü 2 (SARS CoV-2) pozitif polariteli ve tek iplikli bir RNA virüsüdür. Virüsün sebep olduğu COVID19 hastalığı on ay gibi kısa bir sürede 900 binden fazla insanın ölümüne neden oldu. Virüs ile mücadelede etkin ve spesifik bir ilaç ve aşı henüz bulunmamaktadır. İlaç ve aşı geliştirme çalışmaları virüsün yapısal ve fonksiyonel özelliklerinin kapsamlı bir şekilde anlaşılmasını gerekli kılmaktadır. Hızlı yayılım gösteren virüsün yüksek mutasyon hızı geliştirilecek aşı ve ilaçların etkinliklerini sürdürebilmelerinin önündeki en büyük engellerden biridir. Hücresel boyutta viral enfeksiyonun başlangıcında yer alan SARS CoV-2 yapısal olmayan protein 1 (nsp1) önleyici tedavi için potansiyel hedef proteindir. Konak hücre translasyonunu engelleyen nsp1’in yapısının bilinmesi önemlidir. Bu çalışmada 222 Avrupa izolatında görülen nsp1 mutasyonlarının protein yapıda ortaya çıkarabileceği değişimler yapay zekâ tabanlı bir modelleme yazılımı olan trRosetta kullanılarak modellenmiştir. NCBI Virüs veritabanından elde edilen dizi bilgileri MAFFT çoklu dizi hizalama programı ile hizalanmıştır. Mutasyon analizleri RDP4 yazılımı ile yapılmıştır. Mutant protein primer yapı MegaX yazılımı ile oluşturulmuştur. Protein kalite skorları QMEAN algoritması kullanılarak analiz edilmiştir. Proteinleri fizikokimyasla özellikleri ProtParam ExPAsy programı ile yapılmıştır. Elde edilen protein yapıların konformasyonel analizleri PyMOL ile yapılmıştır. SARS CoV-2 Avrupa izolatlarında görülen nsp1 mutasyonlarının protein sekonder ve tersiyer yapısında konformasyonel ve topolojik değişimlere neden olabileceği tespit edilmiştir. SARS CoV-2 katalitik bölgeyi içine alan P153 ve N178 rezidüleri arasında kalan bölgede görülen değişimin proteinin fonksiyonel özelliklerini etkileyebileceği düşünülmektedir. Elde edilen verilerin önleyici ve tedavi edici yaklaşımlara önemli veriler sunabileceği düşünülmektedir.
AtıfOpenAlex1TR Dizin2İncele - MakaleAçık Erişim2020Determination of Microbiological Quality of Fermented Sausage Samples by Fuzzy Logic Approach
Ertekin, Özlem; Kaya, Sema Kayapinar
Mathematical methods may be useful in cases with certainty by using numerical data, but may be insufficient in cases of uncertainty. One of the uncertainties is the quality assessment in the food industry. In this case, one of the methods that can be used is fuzzy logic method. In this study, a fuzzy logic based decision support system was designed for the classification of sausage samples into quality classes. The inputs of the system are Micrococcus/Staphylococcus, Lactobacillus, Yeast-mold count values of fermented sausage samples. The output of the fuzzy system was sausage quality assessment. In order to determine the success of the experimental study, a comparison was made with expert decisions and the system was found to be successful at 85%. The system was modeled using Matlab R2016a package program.
- MakaleAçık Erişim2019Investigation of the Bioremediation of Herbicide Metribuzin with Bacillus subtilis Bacteria at Artifical Agricultural Field
Erguven, Gokhan Onder
The bioremoval of metribuzin (C8H14N4OS) which is one of the selective herbicide in tomato farming in Turkey was investigated with Bacillus subtilis bacteria under agitated culture conditions and artifical agricultural field. The bacterium was isolated in collected soil samples from one of the agricultural area in Elazig province of Turkey. The area is unexposed to metribuzin before. Five apparatuses were set up and 100 mL of metribuzin in 1750 ppm concentration (advised concentration of tomato farmers) was added to each Erlenmayer flasks. 5, 10, 20, 50 and 100 mL of enriched Bacillus subtilis solutions (in sabouraud dextrose broth) added to these flasks. Each mL of the enriched solutions contains ×107 Colony forming unit (CFU). These flasks were shaken at 160 rpm at 28 0C in sterile conditions for 17 days. In 24 hours intervals, each sample was collected to flasks and chemical oxygen demand (COD) was determined with DR/890 colorimeter by the line of closed reflux method while Biochemical oxygen demand (BOD5)experiments were performed via standard methods 5210D with oxitops. As a result of the study, best removal performance observed in 100 mL Bacillus subtilis as 98% at 17 days in COD. In a soil study, 100 mL mixture of Bacillus subtilis consortia used for bioremediation studies. According to the results of artifical agricultural field study, the bioremediation seen at COD and BOD5 parameters are 99.4% and 96% respectively at the end of 2. week. This experiments have focused that, Bacillus subtilis should be a selective type for bioremediation of metribuzin on receiving environments.
AtıfOpenAlex2TR Dizin2İncele - MakaleAçık Erişim2018Cochrane Q Testi ile Farklı Laktasyon ve Farklı Yaşlara Sahip İneklerde Süt Toplam Bakteri Sayılarının Karşılaştırılması
Çimen, Murat; Ertekin, Özlem; Yilmaz Bozok, Yeliz
Özet: Araştırmada, hayvan materyali olarak 12 inek kullanılmıştır. Dört farklı yaş grubu (3,4,5 ve 6) ve üç farklılaktasyon dönemi (erken, orta ve geç) oluşturulmuştur. Süt toplam bakteri sayıları için farklı laktasyon ve yaşgrupları arasındaki farklar araştırmada Cochrane Q testi kullanılarak araştırılmıştır. Araştırma bulgularına göre,farklı laktasyon dönemleri (erken, orta ve geç) ve farklı yaş grupları (3,4,5 ve 6) için ineklerin süt toplam bakterisayıları gruplar arasında istatistiksel olarak farklı değildir. Süt toplam bakteri sayısını etkileyen faktörler iletoplam bakteri sayısı gibi mikrobiyolojik parametreler arasındaki ilişkilerin araştırılması için daha ileri düzeydeçalışmalara ihtiyaç vardır.
- MakaleYalnız künye2016Yüksek Ekonomik Değeri Olan Bazi Su Ürünlerinde Listeria monocytogenes Kontaminasyonunun Giderilmesi için Nisin ve Gama Işınlama Kombinasyonlarının Etkisi
Dikici, Abdullah; Koluman, Ahmet
Küresel tüketimde balık ve diğer su ürünleri önemli rol oynamaktadır. Deniz ürünleri diğer ürünlerle kıyasla daha fazla Listeria monocytogenes kontaminasyonu riski taşımaktadır. L. monocytogenes riski belirli üretim yöntemleri ile düşürülmelidir. Çeşitli çalışmalar Nisin uygulamasının tek veya kombine olarak farklı koşullardaki farklı gıdalarda etkili olduğunu göstermiştir. Bunlara ek olarak, gama ışınlama su ürünlerinde raf ömrünün uzatılması ve patojenlerin dekontaminasyonu için belirgin bir potansiyele sahiptir. Farklı dört adet ekonomik değeri yüksek ürüne gama ışınlaması Nisin içerecek veya içermeyecek şekilde uygulandı. Sonuçlara göre Nisin uygulanmamış gruplarda L. monocytogenes 5 kGy ışın dozu ile eradike edilebilirken, Nisin kombinasyonu uygulanması gereken dozu 3 kGy seviyesine çekmiştir. Buna bağlı olarak farklı su ürünlerinde, Nisin ve ışınlama kombinasyonlarının L. monocytogenes kontaminasyonunun giderilmesinde beraber uygulanmasının verimli olacağı düşünülmüştür.
AtıfOpenAlex1TR Dizin1İncele - MakaleYalnız künye2010Scopus SJRQ3Elazığ’da satılan kremalı pastalarda E. coli O157:H7’nin varlığı
Patır, Bahri; İlhak, O. İrfan; Dikici, Abdullah; Öksüztepe, Gülsüm; Çalıcıoglu, Mehmet
Bu araştırma, Elazığ’da tüketime sunulan kremalı (sade, kakaolu, meyveli) pastalarda Escherichia coli O157:H7’nin mevcudiyetini belirlemek amacıyla yapıldı. Araştırmada 100 adedi sade kremalı, 50 adedi kakao kremalı ve 50 adedi de meyve kremalı olmak üzere toplam 200 kremalı pasta örneği incelendi. Örneklerin zenginleştirme işlemini takiben CT-SMAC besi yerine yapılan ekim sonucunda; 65 sade kremalı örnekten 138; 8 kakao kremalı örnekten 25; 19 meyve kremalı örnekten 45 adet olmak üzere toplam 208 adet tipik koloniden (renksiz-şeffaf) izolasyon yapıldı. Seçilen bu izolatlara E. coli O157:H7 serotipinin teşhisi için metot kısmında verilen ileriki işlem basamakları uygulandı. Ancak tipik E. coli O157:H7 özelliği gösteren suş tespit edilemediği için, izolatlara H7 tayin işlemleri yapılmadı. İncelenen kremalı (sade, kakaolu, meyveli) yaş pasta örneklerinin hiçbirinde E. coli O157:H7 tespit edilemedi. Bu yönüyle, halk sağlığı açısından sevindirici bir durum olmakla birlikte, bu tür ürünlerin çoğu zaman diğer patojen bakterileri de barındırdığı bilinmektedir. Halk sağlığı açısından potansiyel risk durumunun ortadan kaldırılması ve halkımıza sağlıklı pastacılık ürünlerinin sunulması, ancak bu tür ürünlerin hazırlanmasında kesinlikle hijyenik şartlara uyulmasıyla mümkün olabilecektir..
AtıfTR Dizin2İncele